FC Zenit Irkoetsk (Russisch: ФК Зенит Иркутск) is een Russische voetbalclub uit Irkoetsk. De club speelt in de Russische tweede divisie.

Zenit Irkoetsk werd in 1966 opgericht als Start Irkoetsk. In 1980 werd de naam veranderd in Zenit Irkoetsk. De club speelde tot 1992 in de lagere divisies van de Sovjet-Unie. Na de ontbinding van de Sovjet-Unie ging Zenit Irkoetsk spelen in de Russische tweede divisie. In 2000 promoveerde de club naar de Russische eerste divisie, maar degradeerde na één seizoen weer terug. In 2008 won Zenit Irkoetsk de Russische beker, waardoor de club zich kwalificeerde voor de UEFA Europa League. In de Europa League werd Zenit Irkoetsk in de tweede kwalificatieronde uitgeschakeld door het Noorse Strømsgodset IF.